Question

Jaka jest różnica pomiędzy at the end oraz in the end?

Answer 1

At the end- oznacza tłumacząc na polski na końcu.
in the end - oznacza natomiast w końcu.

Dlaczego?  The end oznacza koniec dlatego wiemy, że końce tych wyrażeń to na pewno koniec. At oznacza na- pierwsze zdanie to at(na) the end (koniec)
A drugie in (w) the end (koniec). 

Answer 2

At the end- na końcu
natomiast:
in the end-  w końcu