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ResumenLa costa Peruana central tiene humedales peculiares como Puerto Viejo. Ellos están localizados en el departamento de Lima entre los 70 y 73 km al sur. La colección algal estándar con registros de parámetros fisico- químicos (pH, salinidad:NaCl, temperatura, fosfatos, nitratos) de los ecosistemas acuáticos fueron realizados irregularmente entre 1997 y 2005. Las lagunas superficiales Negruzca y Los Epífitos y la Poza Batis son expuestos al régimen hídrico anual fluctuante durante los periodos de inundación y desecación. Las comunidades planctónicas de euglenoides fueron tipificadas por Euglena gracilis, Euglena agilis, Phacus curvicauda y P. similis. Estas especies colonizan habitats con un rango de pH entre 7 y 9, gradiente de salinidad de 2 a 10 ppm, fosfatos hasta 20 mgl-1 y nitratos hasta 0,88 mgl-1 y temperatura entre 19 y 29,5 °C. P. similis y E. gracilis demostraron plasticidad fenotípica amplia relacionada con el polimorfismo celular. La distribución de las especies euglenoides en aguas salobres y salinas eutróficas demostraron su0 naturaleza eurihalina y colonización exitosa como indicadores de la calidad de agua con materia orgánica en descomposición bajo condiciones inestables y vulnerables de los humedales. Palabras clave: fitoflagelado, euglenoide, indicador, eutrófico, salobre, plasticidad.